La première chapelle de Métabief a été fondée en 1715 à l'emplacement du cimetière. Elle a été remplacée en 1843 par l'église actuelle placée sous le vocable de la Présentation de Notre-Dame.
Ce vocable se réfère à des textes non canoniques, les évangiles n'évoquant pas l'enfance de la Vierge. Ces textes, composés au milieu du IIème siècle et traduits en 1552 par Guillaume Postel racontent une vie imaginaire de Marie, sans souci de vraisemblance géographique mais avec celui de répondre à la demande de fidèles très attachés à la figure de la Vierge Marie.
Le choix de la dénomination de cette église se rattache à cette même dévotion mariale. L’Église de Métabief est constituée d'un clocher-porche carré coiffé d'un toit à 4 pans, d'une nef unique qu'éclairent 4 baies et d'1 chœur.
L'ensemble, simple et dépouillé, suit un schéma fréquemment usité au XIXème siècle consistant à copier les styles des siècles passés. On peut néanmoins souligner la présence de fonds baptismaux en bois peint marron rehaussé d'or provenant d'un édifice plus ancien, peut-être de la chapelle du XVIIIème siècle, et qui rappellent les décors de l'église des Hôpitaux-Neufs.